實時熒光定量pcr ct值偏大的原因是什么

2023-03-09 10:50:20 字數 3186 閱讀 8504

1樓:匿名使用者

ct值偏大是因為擴增產物量低引起的,而後者的原因很多,比如底物濃度低,引物效率低,有抑制反應的物質存在等等。

實時定量pcr的ct值在什麼範圍內算作合理

2樓:染目黒曈

通常情況bai下,我們du認定為15到zhi35ct比較合理,超過35個ct那麼就算它沒dao有擴專增了,如果15之前起峰屬

,那麼就是模板濃度太高所引起的

在熒光定量pcr技術中,有一個很重要的概念 —— ct值。c代表cycle,t代表threshold,ct值的含義是:每個反應管內的熒光訊號到達設定的域值時所經歷的迴圈數

熒光定量pcr ct值很高,都是30幾,怎麼辦

請問:做熒光定量pcr時,△△ct值是什麼意思,它的計算公式是什麼? 20

3樓:禾鳥

△△ct是熒光定量計算公式的簡化形式,用於比較不同樣品之間的差別或變化比率。

ct=-1/lg(1+ex)*lgx₀+lgn/lg(1+ex),其中,n為擴增反應的迴圈次數,x₀為初始模板量,ex為擴增效率,n為熒光擴增訊號達到閾值強度時擴增產物的量。△ct(n)=ct(目的基因)-ct(內參基因);△△ct(n)=△ct(n)-△ct(1)。

起始拷貝數越多,ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫座標代表起始拷貝數的對數,縱座標代ct值。因此,只要獲得未知樣品的ct值,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數。

擴充套件資料

熒光定量pcr的原理:

熒光定量pcr技術:在pcr反應體系中加入熒光基團,通過熒光訊號不斷累積而實現實時監測pcr全程,然後通過標準曲線對未知模板進行定量分析的方法。在實時熒光定量pcr中,對全程pcr擴增過程進行實時檢測,根據反應時間和熒光訊號的變化可以繪製成一條曲線。

實時熒光定量常用的熒光化學分類有sybr green i法和tag man探針法。

ct值:c代表cycle,t代表threshold,ct值的含義是每個反應管內的熒光訊號到達設定的域值時所經歷的迴圈數。

4樓:一生一個乖雨飛

△△ct這是相對熒光定量的一個計算公式的簡化形式,用於比較不同樣品之間的差別或變化比率。

ct= -k lgx0+ b(線性方程)用這個方程可以通過ct值算出樣品的起始濃度

斜率=-1/lg(1+e)

擴增效率e=1, 斜率=-3.32

擴增效率範圍:90%-110%

斜率範圍:-3.1和-3.59之間

例如,想看a基因和b基因在某細胞系中表達量的差別,選取18s作為內參基因,就用a基因的ct值減去18s的ct值,得到△ct1,用b基因的ct值減去18s的ct值得到△ct2,然後用△ct1-△ct2=△△ct,而a,b基因的表達量差別為2(-δδct)次方。

當然這計算方法是基於熒光定量的數學計算模型簡化來的,平時使用沒什麼問題,如果兩個目的基因的擴增效率不一樣,這個計算方法是不能用的。

5樓:匿名使用者

ct= -k lgx0+ b(線性方程)用這個方程可以通過ct值算出樣品的起始濃度

斜率=-1/lg(1+e)

擴增效率e=1, 斜率=-3.32

擴增效率範圍:90%-110%

斜率範圍:-3.1和-3.59之間

△△ct這是相對熒光定量的一個計算公式的簡化形式,用於比較不同樣品之間的差別或變化比率

例如,想看a基因和b基因在某細胞系中表達量的差別,選取18s作為內參基因,就用a基因的ct值減去18s的ct值,得到△ct1,用b基因的ct值減去18s的ct值得到△ct2,然後用△ct1-△ct2=△△ct,而a,b基因的表達量差別為2(-δδct)次方,當然這中計算方法是基於熒光定量的數學計算模型簡化來的,平時隨便用用沒什麼問題,如果你的兩個目的基因的擴增效率不一樣,這個計算方法是不能用的。

6樓:匿名使用者

我這邊有關於△△ct法的相關文獻以及推導公式,方便的話可以給我留一下你的郵箱

熒光定量pcr的結果(ct值)怎麼分析

7樓:匿名使用者

目的基因熒光達到閾值時的迴圈數~ct值越低代表起始模板數量越大~

熒光定量pcr得出的ct值是40是什麼意思

8樓:親密愛人傲

△△ct = △ct(試驗樣品

bai) —du △ct(基準樣品

zhi)

△ct(試驗樣品) = ct(試驗樣品,目的基因)dao —內 ct(試驗樣品,內參基因)

△ct(基準容樣品) = ct(基

準樣品,目的基因) — ct(基準樣品,內參基因)2 -△△ct =2 -(-1.2)= 2.30

實時熒光定量pcr因子表達量越少ct值越小嗎

9樓:匿名使用者

所謂ct值,就是最先出

現超過閾值訊號的那個迴圈數。或者說是到了第幾個迴圈專才出現超過閾值的訊號。屬

c代表的是cycle,迴圈數目,t代表的是threshold,閾值。

所以表達量越少的話,需要越多的迴圈才能擴增出來。也就是ct值越高

10樓:匿名使用者

表達量越高ct值越小,成反比。

實時熒光定量pcr ct值偏大的原因是什麼

11樓:茂桐富察通

ct值偏大是因為擴增產物量低引起的,而後者的原因很多,比如底物濃度低,引物效率低,有抑制反應的物質存在等等。

12樓:

正常的,因為你提取兩個材料的rna的量不同。你根據資料算下表達量具體是差幾倍,看是否與你的預期相符

定量pcr中ct值的定義

13樓:匿名使用者

ct值:c代表cycle,copyt代表threshold,ct值的含義是:bai每個反應管內的熒du光訊號到達設定的域值時zhi所經歷的迴圈數

daopcr反應的前15個迴圈的熒光訊號作為熒光本底訊號,熒光域值的預設設定是3-15個迴圈的熒光訊號的標準偏差的10倍

14樓:匿名使用者

每個反應管內的熒光訊號達到所設定的閾值時,所經歷的反應迴圈數。

熒光定量pcrct值很高,都是30幾,怎麼辦

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實時熒光定量pcr因子表達量越少ct值越小嗎

所謂ct值,就是最先出 現超過閾值訊號的那個迴圈數。或者說是到了第幾個迴圈專才出現超過閾值的訊號。屬 c代表的是cycle,迴圈數目,t代表的是threshold,閾值。所以表達量越少的話,需要越多的迴圈才能擴增出來。也就是ct值越高 表達量越高ct值越小,成反比。pcr ct值越高是否說明表達越低...