1樓:芊雲說電影
脈衝場凝膠電泳-高分子量dna瓊脂糖凝膠塊製備和加工。
1.收集10ml全血,加入30ml細胞裂解液。置冰浴中至少20min直至紅細胞完全溶解。
2.2000r/min離心10min,移去紅色上清液,再次用細胞裂解液洗滌細胞,然後用pbs重懸細胞。
3.稀釋單細胞懸液並取一小份用neubauer腔計數細胞。
4.用pbs重懸細胞,以達到40μl pbs中含1百萬個細胞比例(1百萬個二倍體哺乳動物大約含有基因組dna 10μg)
5.用pbs配製2%濃度低熔點瓊脂糖溶液並保持在50℃。
6.將等體積(各1ml)細胞懸液與瓊脂糖溶液於室溫下混勻,立即倒入凝膠塊模具中。
7.靜置20min讓瓊脂糖固化,用無菌塑料杯(通常用作劃菌)將凝膠塊自模具中取出並置入蛋白酶緩衝液中,加入2mg/ml的蛋白酶k。
8.將帶有凝膠塊的蛋白酶k緩衝液於50℃保持2~3天。每個盛有50ml蛋白酶緩衝液的falcon管可容納多達100個凝膠塊。
9.蛋白酶k消化後,可將凝膠塊保留在此緩衝液或 edta溶液中儲存於4℃。
10. 此外,繼續將凝膠塊用高壓消毒過的te緩衝液沖洗數遍的步驟。
11. 將凝膠塊放入裝有te及 pmsf溶液的falcon試管中,滅活殘留的蛋白酶k。
12. 室溫下用te溶液漂洗凝膠塊數次,將凝膠塊放入另一干淨的試管,可直接用於酶切反應或用。
edta,(儲存凝膠塊。
13. 若用edta儲存凝膠塊,取出後應用te溶液室溫下漂洗30 min×2次。
脈衝場凝膠電泳的凝膠電泳
2樓:網友
1.將的瓊脂糖在中熔化後冷卻至50~60℃,立即注入凝膠框架中,並插入梳子。
2.凝膠固化後小心地拔出齒梳,用2把無菌手術刀將dna凝膠塊上樣。若用不同內切酶消化凝膠塊,則取不同樣品時應將手術刀片燒灼後冷卻。將dna大小標誌物上樣至凝膠的兩旁。
3.用1%液態低熔點瓊脂糖凝膠(配製)密封狹槽。
4.若有氣泡存在,用注射器驅趕氣泡。
5.一旦密封的低熔點瓊脂糖已固化(大約10min),可將凝膠擱入腔室,並用電泳緩衝液覆蓋過膠面。
6.應設定合適的電壓及轉換時間(參考《分子醫學技術》84頁表並開始電泳。兩個不同電泳方向的電流應相等。
7.電泳結束後,凝膠用配製成的eb(染色。
8.用幫浦自槽中排除緩衝液,續以雙蒸水沖洗電泳槽。
9.凝膠成像:dna在**的過程中可能會形成缺口。
10. 用 hcl漂洗凝膠30min,讓dna脫嘌呤,並有利於轉移。
11. 凝膠用鹼(變性溶液中)變性20min,兩次,續以中性溶液1~5min。
12. 採用標準southern印跡方案將dna轉印至尼龍膜上。一般來說,印跡pfge凝膠的時間較普通凝膠印跡時間長(約48h)。
脈衝場凝膠電泳的標準物
3樓:神水盟
1.以te緩衝液懸浮λ多聯體(boehringer ma寶靈曼公司產品),濃度為4μg/40μl。
2.用等體積te配製的2%低熔點瓊脂糖(溫度保持在45℃)混勻。
3.移去混合液注入預冷的凝膠塊模具中。
4.室溫下用te及100 mmol/l nacl溶液溫育2天。 1.從ypd(酵母提取物,蛋白腖和葡萄糖)培養基瓶皿中挑選單一轉殖加入10ml
ypd預培養的肉湯中,30℃下劇烈**生長24小時,然後加入200ml ypd肉湯,劇烈振盪24~48h(產量大約100塊)。
2.4000×g轉速,離心10min,然後用50mmol/l edta/10 mmol/l tris-hcl(溶液懸浮。
3.仍以4000×g轉速離心10min,再用sce[1 mol/l 山梨醇,枸椽酸鈉,及10 mmol/l
edta (溶液重懸。
4.取稀釋後的細胞懸液用neubauer腔計數。
5.溶液短暫離心後,再用sce重懸細胞,使40μl sce溶液中含5×107個細胞(相當於80μl體積的模組中含有5×107個細胞)。
6.溶液與酵母扣糖酶100t和100mmol/lβ-巰基乙醇混勻,37℃保溫15~30min。
7.細胞懸液與等體積的sce配製的2%低熔點瓊脂糖凝膠混勻,保持在50℃。
8.將混合物移注入預冷的凝膠塊模具中。
9.凝膠塊用含10 mmol/l二硫蘇糖醇的sce溶液37℃下振盪溫育1~2小時。
10. 將凝膠塊移入蛋白酶緩衝液中,加入2mg/ml蛋白酶k,50℃溫育48h。
11. 用50 mmol/l edta/10 mmol/l tris-hcl(溶液洗滌凝膠塊3次,每次20min。
12. 凝膠塊可用此混合液於4℃儲存或不用漂洗直接裝載入凝膠中。
請教關於脈衝場凝膠電泳中的一材料(半小時內再追加100)
4樓:網友
呵呵,今天巡視罈子,才看到你的帖子,就是這麼個東西。
脈衝場凝膠電泳能用來進行微生物鑑定嗎?我從土壤中分離了一種細菌,能用該儀器嗎?網上有比對的**嗎?
5樓:網友
你已經得到了這株菌是嗎?
形態,生理生化結合分子生物學鑑定即可。
如果沒有形態分類學基礎,可以直接先做分子鑑定,比對後看大概屬於哪個種後再詳細分析。
分子鑑定步驟:
1.液體培養細菌,一般條件37度24小時即可。
2.菌液pcr。擴增16srdna序列,所用引物網上都有,查到後,將序列傳送生物公司合成。pcr反應條件網上也都有。
3.測序。擴增得到的序列送生物公司測序,ncbi上比對,即可。
跑電泳的時候分子量大的片段跑不開的原因是什麼
6樓:煜淑雅旎
膠解像度不夠 大片段運動時速度很慢,片段之間的距離就拉不開,肉眼也看不清條帶。
對於分子量十分大的片段,可以用脈衝場凝膠電泳。也可以延長電泳時間(此時前面的小分子dna可能會跑出膠外。如果你要的只是大片段,延長電泳時間還是可行的。
畢竟脈衝場凝膠電泳要特殊裝置,麻煩。
瓊脂糖凝膠電泳marker的作用
瓊脂糖凝膠電泳marker的作用是分子標記。dna分子標記具有的優越性有 大多數分子標記為共顯性,對隱性性狀的選擇十分便利 基因組變異極其豐富,分子標記的數量幾乎是無限的 在生物發育的不同階段,不同組織的dna都可用於標記分析 分子標記揭示來自dna的變異 表現為中性,不影響目標性狀的表達,與不良性...
凝膠電泳實驗樣品需要加熱嗎急急急
樣品需要加入上樣緩衝液後在100度煮沸10分鐘使蛋白變性後冷卻,12000rpm 10分鐘離心,取上清上樣,不然會堵孔。希望能幫到你 您做的是哪一類凝膠電泳?核酸凝膠電泳不需要加熱。蛋白非變性凝膠電泳一般也不必加熱。蛋白變性凝膠電泳需要煮沸5 10分鐘變性。不同的凝膠電泳需求不同。實驗樣品不需要加熱...
瓊脂糖凝膠電泳分離dna的有效範圍是什麼意思
乙個給定大小的線狀dna分子,其遷移速度在不同濃度的瓊脂糖凝膠中各不相同。dna電泳遷移率的對數與凝膠濃度成線性關係。凝膠濃度的選擇取決於 dna分子的大小。分離小於的dna段所需膠濃度是,分離大於kb的dna分子所需膠濃度為,dna段大小間於兩者之間則所需膠濃度為。凝膠電泳技術為什麼能分離dna ...