1樓：清風明月樹下
這個不會超過1w,乙個轉錄組4g大概8000~9000吧，建庫測序加分析。
2樓：得意兒的一撥一
當然轉錄組測序了，雖然費用上貴了點，但省時省力，而且深度高。用晶元的話會漏掉很多差異基因。
原核轉錄組為什麼建鏈特異性文庫
3樓：楊風遊
鏈特異性轉錄組測序（strand-specific rna sequencing）是指在構建測序文庫時，利用illumina高保真taq酶將mrna鏈的方向資訊儲存到測序文庫中。測序後的資料分析可確定轉錄本是來自正義還是反義dna鏈。與普通轉錄組測序相比，它更能準確地統計轉錄本的數量和確定基因的結構，同時可以發現更多的反義轉錄本，目前被廣泛地應用於研究基因結構和基因表達調控等領域範圍。
轉錄組測序有參考基因組和無參考基因組的區別
4樓：砂粒
轉錄組測序是rna水平測序，相當於dna水平的基因。
組測序，是乙個框架。表達譜主要研究的是基因表達量的變化，上調或下降。先要有轉錄組或是基因組才可以做表達譜，否則沒有ref做參考。
轉錄組測序和表達譜其實都是通過高通量測序技術進行的，轉錄組測序主要是針對沒有參考基因組（即基因組未完成測序）的物種，側重於獲得你材料的全部轉錄組資訊；而表達譜則側重於檢測各個基因的表達量。
什麼是轉錄組分析
5樓：醉意撩人殤
轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的集合的分析。
轉錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內所有轉錄產物的集合，包括信使rna、核糖體rna、轉運rna及非編碼rna；狹義上指所有mrna的集合。
轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶（oligo-dt）進行親和純化的rna聚合酶ii轉錄生成的成熟mrna和ncrna進行高通量測序。
相對於傳統的晶元雜交平臺，轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針，即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測，提供更精確的數位化訊號，更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍，是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。
6樓：黑石礁畔
轉錄組是指某個物種或特定細胞在某一生理功能狀態下，細胞內所有轉錄的mrna產物的集合，包含了時間和空間的限定，是連線基因組遺傳資訊與生物功能的蛋白質組的必然紐帶。轉錄水平的調控是目前研究最多的，也是生物體最重要的調控方式。
應用高通量技術進行轉錄組測序是一種快捷可靠的獲取轉錄組資訊的方法。mrna的轉錄本表達分析，通過獲得研究物件基因組轉錄區域的資訊，鑑定轉錄發生位點，可變剪下等，其精確的計數方法更可對基因進行精確的定量分析。
7樓：七叔之家
轉錄組分析包括，編碼基因的分析，翻譯蛋白的**，外顯子內含子的剪下拼接，轉錄本的結構分析功能分析，二級結構等等，或者基因的差異表達。
求問各位轉錄組分析高手，轉錄組測序與rna-seq（quantification） 有什麼區別，從原理上和適用性上？感謝
8樓：葛肩胛骨
轉錄組測序與 rna-seq前期實驗樣本的處理是沒有差別的，主要是測序量的不同及生物資訊側重點的不同，相對來說，轉錄組測序適合於大物種及基因組參考序列相對來說較差的物種，以及無參考基因組的物種，而rna-seq 更適合於參考基因相對明確，老師只想尋找基因表達差異的物種樣本，如擬南芥 等 。
9樓：須諾
基本是一樣的，名稱叫法不一樣。
求助,關於轉錄組測序結果分析,什麼是轉錄組分析
即測序所產生的reads在參考基因組比對所佔的比例。比對率越高說明你的資料的利用率越高。一般情況下看參考基因組的情況和測序的質量,一般在70 以上都是可以接受的。什麼是轉錄組分析 轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的集合的分析。轉錄組 transcriptome 廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄...
轉錄組？轉錄組研究的方法有哪些，什麼是轉錄組分析
研究主要指具體的研究方法 手段和工具。每一課題都要有相應的研究方法，一般可以採取綜合的方法，或者以一種方法為主，其它方法為輔。這樣有利於收集多方面的資訊，可以得到可靠的結論。下面介紹課題中常用的幾種研究方法。一 行動研究法 1 行動研究是由社會情境 包括教育情境 的參與者為提高對所從事的社會的或教育...
細菌基因組測序完畢後進行基因組註釋需要耗時多久
做全基因來組測序前,自需要檢測dna濃度和純度巨集基因組是指特定環境中全部生物 微生物 遺傳物質的總和。巨集基因組測序是利用高通量測序技術對環境樣品中全部微生物的基因組進行測定,以獲得單個樣品的飽和資料量,可進行微生物群體的基因組成及功能註釋,微生物群體的物種分類,多樣性分析,群落結構分析,樣品間的...