細菌基因組測序完畢後進行基因組註釋需要耗時多久

2021-03-03 20:27:35 字數 973 閱讀 4441

1樓:匿名使用者

做全基因來組測序前,自需要檢測dna濃度和純度巨集基因組是指特定環境中全部生物(微生物)遺傳物質的總和。巨集基因組測序是利用高通量測序技術對環境樣品中全部微生物的基因組進行測定,以獲得單個樣品的飽和資料量,可進行微生物群體的基因組成及功能註釋,微生物群體的物種分類,多樣性分析,群落結構分析,樣品間的物種或基因差異以及物種間的代謝網路研究,探索微生物與環境及宿主之間的關係,發掘和研究新的具有特定功能的基因等。與傳統方法相比,基於高通量測序的巨集基因組研究無需構建克隆文庫,這避免了文庫構建過程中利用宿主菌對樣品進行克隆而引起的系統偏差,簡化了實驗操作,提高了測序效率。

此外,巨集基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養的限制,擴充套件了微生物資源的利用空間,為環境微生物群落的研究提供了有效工具。通過巨集基因組深度測序可以揭示或估計環境中真實的物種多樣性和遺傳多樣性,挖掘具有應用價值的基因資源,應用於開發新的微生物活性物質,為研究和開發新的微生物活性物質提供有力支援。

細菌全基因組測序請問現在全基因組測序完成後會的到

2樓:悠悠我心

目前已完成全基因組測序的物種主要可以分類三大類,模式物種、農作物和經濟作物、有藥用價值的物種。在模式物種這塊,眾所周知的,擬南芥、果蠅、斑馬魚、小鼠、大鼠等等;而農作物和經濟作物大概有以下:水稻、玉米、大豆、甘藍、白菜、高粱、黃瓜、西瓜、馬鈴薯、番茄、擬南芥、楊樹、麻風樹、蘋果、桃、葡萄、花生;在藥用這塊,目前主要有一些真菌類,例如靈芝、茯苓等,以及一些藥用植物,例如丹蔘、長春花等。

您好,想諮詢下細菌全基因組測序問題

3樓:愛北極光

代謝通路是kegg資料庫裡的pathway資料庫。

可以通過全基因組**了編碼基因後,進行版pathway資料庫註釋,權從註釋結果的功能資訊中通過關鍵字查詢。

一般都能找到。

如果找不到,有可能是關鍵字不對或者基因組中沒有這樣的代謝通路功能基因。

個人全基因組重測序需花費多少錢,全基因組測序,有必要做嗎

人類基因組大小 bai3g,重測du序一般需要測定至少20x以上的zhi資料dao 資料乘數高的話對於資訊分析版是權有利的 也就是說一般需要測定60g的資料,如果1g按照5000元算的話,需要30萬元。不過要看你的目的,現在illumina推出的my seq測1個人的好像只需要幾萬。聯合基因有如下產...

為什麼測定基因組只測24條,為什麼測定基因組只測24條

人類有bai23對染色體 每一du對同源染色體形態大zhi 小相同,結構相dao 似,上面分佈的基因是相同的內或者是等位基容因,人類基因組計劃最開始的階段是要對人類基因進行測序,所以對於一對同源染色體只檢測一條就可以了,但是有一個例外,就是男性的 y 染色體,雖然和x染色體是同源染色體,但是結構相差...

已經做完細菌的全基因組測序,怎麼能夠找到我要的某個基因的代謝

代謝通路是kegg資料庫裡的pathway資料庫。可以通過全基因組 了編碼基因後,進行pathway資料庫註釋,從註釋結果的功能資訊中通過關鍵字查詢。一般都能找到。如果找不到,有可能是關鍵字不對或者基因組中沒有這樣的代謝通路功能基因。一般現在的科技服務公司如果做了kegg pathway資料庫註釋的...