華大基因illuminahiseq測序結果怎麼看

2021-03-03 20:27:35 字數 2801 閱讀 2362

1樓:紫羅蘭丶花開

過長的測序週期以及上萬美元的儀器成本,成了阻礙基因測序進入尋常百姓家的障礙。而運用新技術的基因測序儀大大降低了基因組測序的門檻,使得更多研究人員能夠使用這項技術開發多種應用。

小白求助,華大基因測序結果如何分析

2樓:

目前國際上通用的基因組

de novo

測序方法有三種:

1. 用illumina solexa ga iix測序儀直接測版序;2. 用roche gs flx titanium直接完成全基因組測序;

3.用abi 3730 或權roche gs flx titanium測序,搭建骨架,再用illumina solexa ga iix進行深度測序,完成基因組拼接。

illumina hiseq x ten和2000的測序資料有什麼區別

3樓:健振韋天

不清楚這個易瑞什麼來路,目前的基因檢測主要有2類,一類是通過snp位點(基本上是以snp晶片為手段,也有針對單基因或少數幾個基因位點的使用的是pcr加測序或分型的方式),還有一類是對全基因組進行測序,一般目前採用的是hiseq x-ten測序。

**上第一種如果是幾百萬個snp位點的一般是1000元左右,如果是單基因或少數幾個基因的也就幾十塊錢。第二種全基因組測序的一般測序深度30x以上,90g左右資料,測序費用大概在8000左右,分析snp和indel的變異費用在1000左右。

但是,目前完全不建議做。因為snp的變異與疾病和表型的研究完全不夠充分。單基因的遺傳疾病根本不用測序自己就看出來了,多基因的複雜疾病基因遺傳因素所佔比例有限,只是一個相關概率問題,而且即便知道了也沒什麼手段,早點拿到的資料也是一堆atcg和snp變異和所謂風險值。

還有測序和資料分析費用在飛速下降,目前上萬的全基因組測序同樣的資料可能1年後只用幾百塊,真正有效的解讀也還要等到幾年後,沒必要花這個冤枉錢。

但是以下人群有這個切實需要:腫瘤的突變分型(目前並沒有特別靠譜的高通量測序產品,主要還是基於熒光定量pcr的檢測試劑盒),新生兒的遺傳病篩查(看個人接受程度)

高通量測序 illumina hiseq 2000 和roche454 兩種平臺的區別

4樓:土豆檸檬絲

他們復是兩家不同公司的測序制平臺

1.原理

illumina的hiseq2000和454都是通過單序列的擴增放大訊號,只是hiseq2000中間有橋式擴增,可以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。

2.資料分析和應用方向

資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。

3.通量和**

hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。

綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

illumina測序技術術語 lane和run是什麼意思

5樓:匿名使用者

illumina的測序儀是以flowcell進行測序的,一般的一張flowcell是一個run,像hiseq2500的話是2張flowcell,也就是一次執行專的測序量屬。每張flowcell上通常都有多個通道,每個通道可以單獨測不同的樣品,這樣的通道就是lane。hiseq2500的一張flowcell有8條通道,也就是8個lane。

如果上機前使用cbot的話可以每條lane都跑不同的樣品,互不干擾,如果直接上機進行快速模式的話就無法區分不同樣本了。

hiseq測序和miseq測序的區別是什麼

6樓:言吾測序

通量和速度的區別(導致應用方向就不同了),其他一樣。

hiseq的測序通量遠大於miseq,而miseq的測序耗時明顯短於hiseq。

測序原理相同。

illumina最新的試劑(上機測序試劑)有哪些

7樓:匿名使用者

他們是兩

抄家不同公司的測序襲平臺1.原理illumina的hiseq2000和454都是通過bai

單序du列的擴增放大訊號,只zhi是hiseq2000中間有橋式擴增,可dao以兩頭測序。測序長度來講,hiseq2000一般為1x100和2x100的模式,而454平均500bp左右,最長700左右,測序準確度來講hiseq的測序準確度稍高一些,454由於在測序的過程每次是加一種鹼基,所有如果是單鹼基重複,比如aaaa,那麼區分幾個a的準確性就會下降。2.

資料分析和應用方向資料分析相差不大,只是不同的軟體,應用方面兩者各有優勢,hiseq2000資料適應性更高。454一般是巨集基因組種群丰度測序上應用更好一些,不過illumina也有miseq代替。3.

通量和**hiseq2000的通量要高一些,**比454便宜很多。綜合來講454現在應用面比較窄了,所以在市場上現在也慢慢被代替掉了。現在耗材和試劑也很快就停服務了。

不過hiseq現在市場上也都2500居多了,並且現在也有新的的技術更新的3000和4000。說實話現在hiseq2000也很少了。

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