測序後如何分析基因突變,如何根據測序結果判斷基因是否有突變?

2021-04-17 22:08:49 字數 3288 閱讀 9044

1樓:匿名使用者

基因測序技復

術與目前市場上存在的制基因檢測技術的對比:baidudna 測序技術的優勢:

dna 測序技zhi術是人類探知大自然dao和人類自身生命奧祕的基本**,所有生物基因組序列的資料,都來自於 dna 測序。 這一技術已經發展數十年,無論是技術原理、技術流程、試劑耗材、儀器裝置,還是質量標準,在國際上都達到了高度規範統一。 dna 測序技術穩定、簡便,自動化程度高;所得資料為直接的基因組序列,準確、資料可重複性好,被公認為國際金標準。

由於歷經人類基因組計劃、人類單倍體型計劃、水稻基因組計劃、家蠶、家雞以及家蠶基因組計劃等重大國際專案的錘鍊,我國已經建立了一個高通量、高質量、低成本的基因組學的科研和技術平臺,從測序到生物資訊學資料分析到儀器裝備自動化、國產化,逐漸形成了產學研一體的生物產業鏈。

基因檢測是從血液、口腔黏膜、其他體液或細胞中檢測一個人的dna的技術。基因檢測技術是檢測引起遺傳性疾病的突變基因,所以基因檢測可用於疾病風險的**。利用基因檢測技術在疾病發生前發現疾病發生的風險,早發現、早預防、早**,進行主動的健康管理,目前有一千多種遺傳疾病可以通過基因技術做出**。

如何檢測基因突變是不是由單基因突變

全基因組測序 怎麼挑選有意義突變

2樓:楊風遊

首先需要了解基因組測序的作用與意義:通過基因比對了解物種的進化與變異;分析物種的致病基因。這主要是群體遺傳學與比較基因組學的內容。

ncbi提供了不同物種的基因資訊,但提交是否完全?提交完全了是否可靠?顯然即便提交完全也不一定精確,因為不同課題組採用的物種存在地域等多種背景差異,這也是為什麼我國在人類基因組計劃完成之後還要開展「炎黃計劃」等測序工作的原因,現在華大基因又在進行青藏高原藏族人群高原適應關鍵基因的測序與研究,遺傳多型在作怪罷了。

所以無論有無資料提交到ncbi上,你的工作都將是有意義的,關鍵在於資料的比對與分析。

同時要知道全基因掃描方法許多,記得當時我們用的是abi 3730測序儀,自己測。另外樣本的需求量以及有無外來物種干擾等。要和導師多交流,瞭解導師短期與中長期的科研規劃,因為你也許接的是碩士課題,也許是博士課題的一部分前期工作,直接可以延伸到博士階段。

祝研究工作順利開展!

3樓:朝著江河走

跟性狀關聯分析一下,關聯性強再拿出來做驗證

4樓:天涯招角

優選啊。好的留下,不好的甩出。

關於基因測序的幾個問題!

5樓:匿名使用者

根據一些文獻的支援,先片段化,效果較好。因為這樣的隨機性比先合成要好。

2.加入index只是為了區分每個上機樣品,便於分析。對結果沒有什麼目的和影響

3.如果技術試驗流程沒有問題的話,有的時候是因為物種本身的特殊性,諸如,雜合度過高,重複序列過高。

6樓:會聽真

dna測序原理和方法

dna序列測定分手工測序和自動測序,手工測序包括sanger雙脫氧鏈終止法和maxam-gilbert化學降解法。自動化測序實際上已成為當今dna序列分析的主流。美國pe abi公司已生產出373型、377型、310型、3700和3100型等dna測序儀,其中310型是臨床檢測實驗室中使用最多的一種型號。

本實驗介紹的是abi pri** 310型dna測序儀的測序原理和操作規程。

【原理】 abi pri** 310型基因分析儀(即dna測序儀),採用毛細管電泳技術取代傳統的聚丙烯醯胺平板電泳,應用該公司專利的四色熒光染料標記的ddntp(標記終止物法),因此通過單引物pcr測序反應,生成的pcr產物則是相差1個鹼基的3'末端為4種不同熒光染料的單鏈dna混合物,使得四種熒光染料的測序pcr產物可在一根毛細管內電泳,從而避免了泳道間遷移率差異的影響,大大提高了測序的精確度。由於分子大小不同,在毛細管電泳中的遷移率也不同,當其通過毛細管讀數視窗段時,鐳射檢測器視窗中的ccd(charge-coupled device)攝影機檢測器就可對熒光分子逐個進行檢測,激發的熒光經光柵分光,以區分代表不同鹼基資訊的不同顏色的熒光,並在ccd攝影機上同步成像,分析軟體可自動將不同熒光轉變為dna序列,從而達到dna測序的目的。分析結果能以凝膠電泳圖譜、熒光吸收峰圖或鹼基排列順序等多種形式輸出。

它是一臺能自動灌膠、自動進樣、自動資料收集分析等全自動電腦控制的測定dn**段的鹼基順序或大小和定量的高檔精密儀器。pe公司還提供凝膠高分子聚合物,包括dna測序膠(pop 6)和genescan膠(pop 4)。這些凝膠顆粒孔徑均一,避免了配膠條件不一致對測序精度的影響。

它主要由毛細管電泳裝置、macintosh電腦、彩色印表機和電泳等附件組成。電腦中則包括資料收集,分析和儀器執行等軟體。它使用最新的ccd攝影機檢測器,使dna測序縮短至2.

5h,pcr片段大小分析和定量分析為10~40min。

由於該儀器具有dna測序,pcr片段大小分析和定量分析等功能,因此可進行dna測序、雜合子分析、單鏈構象多型性分析(sscp)、微衛星序列分析、長片段pcr、rt-pcr(定量pcr)等分析,臨床上可除進行常規dna測序外,還可進行單核苷酸多型性(snp)分析、基因突變檢測、hla配型、法醫學上的親子和個體鑑定、微生物與病毒的分型與鑑定等。

【試劑與器材】

1.bigdye測序反應試劑盒 主要試劑是bigdye mix,內含pe專利四色熒游標記的ddntp和普通dntp,amplitaq dna polymerase fs,反應緩衝液等。

2.pgem-3zf (+) 雙鏈dna對照模板 0.2g/l,試劑盒配套試劑。

3.m13(-21)引物 tgtaaaacgacggccagt,3.2μmol/l,即3.2pmol/μl,試劑盒配套試劑。

4.dna測序模板 可以是pcr產物、單鏈dna和質粒dna等。模板濃度應調整在pcr反應時取量1μl為宜。本實驗測定的質粒dna,濃度為0.2g/l,即200ng/μl。

5.引物 需根據所要測定的dn**段設計正向或反向引物,配製成3.2μmol/l,即3.2pmol/μl。

如重組質粒中含通用引物序列也可用通用引物,如m13(-21)引物,t7引物等。

6.滅菌去離子水或三蒸水。

7.0.2ml或和0.5ml的pcr管 蓋體分離,pe公司產品。

8.3mol/l 醋酸鈉(ph5.2) 稱取40.8g naac·3h2o溶於70ml蒸餾水中,冰醋酸調ph至5.2,定容至100ml,高壓滅菌後分裝。

9.70%乙醇和無水乙醇。

10.naac/乙醇混合液 取37.5ml無水乙醇和2.5ml 3mol/l naac混勻,室溫可儲存1年。

11.pop 6測序膠 abi產品。

12.模板抑制試劑(tsr) abi產品

如何分辨基因突變發生在體細胞還是發生在配子

如果性狀異常在自身上就能找到相對性狀,像人的耳垂性狀左右耳垂有差異,可以直接判斷基因突變發生在體細胞中 如果無法通過自身對比確定,就需要取身體不同部位細胞用基因探針檢測。基因突變是在有絲 或者減數 間期 如何確定新突變是否是體細胞突變 惡性腫瘤的遺bai傳形式可以通du過配子傳給後代 zhi但是,惡...

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用popgene可以算出基因頻率和pic,相似係數是在你用ntsys軟體過程中自動生成的啊,遺傳距離gd 1 gs不就可以了 popgene結果中怎麼計算等位基因頻率 期望雜合度是理論計算得出的雜合度。觀測雜合度是隨機抽取的兩個樣本的等位基因不相同的概率。計算公式如下 觀測雜合度 ho 觀察得到雜和...

基因表達譜篩選出差異表達基因後,應該如何來研究差異基因的功能

你這個表達差異肯定是做了不同的處理之後吧 所以這基因的功能肯定和這個處理誘導的結果相關啊 然後就過表達或者抑制該基因的表達 在細胞水平驗證表型是否正確 採用控制變數法,可以保持其他不變,讓研究物件變化,來發現你要研究的基因的功能的不同。基因表達差異 為什麼選2倍為標準 差異表達基因分析是根據表型協變...