如何根據等位基因數計算基因頻率和PIC值

2021-03-03 21:35:50 字數 493 閱讀 4589

1樓:匿名使用者

用popgene可以算出基因頻率和pic,相似係數是在你用ntsys軟體過程中自動生成的啊,遺傳距離gd=1-gs不就可以了

popgene結果中怎麼計算等位基因頻率

2樓:

期望雜合度是理論計算得出的雜合度。觀測雜合度是隨機抽取的兩個樣本的等位基因不相同的概率。計算公式如下:

觀測雜合度(ho)=觀察得到雜和個體數/ 樣本個體數總數。預期雜合度值(he)根據nei(1978) 提供的公式計算: nhe =1-∑ pi 2 i=1其中pi是第i個等位形式的頻率,所有位點的等位形式頻率由軟體popgene32計算得出, n是等位形式的數目。

he值的範圍從0(說明無多型性)到1(說明無限多個等位形式具有相同的頻率,是個極限值多型資訊含量是指dna的多型性指標等位基因數是反映群體遺傳變異大小的一 個指標,其數值越接近所檢測到的等位基因的絕對數,表明等位基因在群體中分佈越均勻。

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