1樓：
可以用指令碼，也可以用ncbi的工具。
用什麼做的blast，命令是什麼。
轉殖未知基因的序列，測序後blast進行了比對，是我們想要的序列，接下來對序列還要進行什麼分析？
2樓：網友
看你的實驗目的啊。如果只想做個片段，那就進行下生物資訊學分析，比如多重序列比對、生物進化樹分析、蛋白質結構**等。
3樓：韓小霞
如果你需要全序列設計引物繼續測序就可以。
4樓：旭旭是個豬
做個和已知序列的矩陣或系統發育進化樹的構建。
5樓：網友
跟同類物種的基因進行比對（用dnaman)，然後翻譯成蛋白質繼續比對，如果差異較大，有研究的價值，差異較小，基本上沒有研究的價值。
如何通過生物資訊學獲得乙個基因家族的所有序列
6樓：匿名使用者
序列比對其意義是回從核酸、氨基酸答的層次來比較兩個或兩個以上符號序列的相似性或不相似性，進而推測其結構功能及進化上的聯絡。研究序列相似性的目的是通過相似的序列得到相似的結構或功能，也可以通過序列的相似性判別序列之間的同源性，推測序列之間的進化關係。序列比對是生物資訊學的基礎，非常重要。
序列比對中最基礎的是雙序列比對，雙序列比較又分為全域性序列比較和區域性序列比較，這兩種比較均可用動態程式設計方法有效解決。在實際應用中，某些在生物學上有重要意義的相似性不是僅僅分析單條序列，只能通過將多個序列對比排列起來才能識別。比如當面對許多不同生物但蛋白質功能相似時，我們可能想知道序列的哪些部分是相似的，哪些部分是不同的，進而分析蛋白質的結構和功能。
為獲得這些資訊，我們需要對這些序列進行多序列比對。多重序列比對演算法有動態規劃演算法、星形比對演算法、樹形比對演算法、遺傳演算法、模擬退火演算法、隱馬爾可夫模型等，這些演算法都可以通過計算機得以解決。
如何在酵母資料庫中通過蛋白序列blast得到氨基酸序列
7樓：
ncbi ncbi下有很多資料庫，以下源局頌是蛋白質序列。
popset 包含研究乙個人群、乙個種系發生或描述人群變化的一組組聯合序列。popset既包含核酸序列資料又包含蛋白質序列資料。
entrez 功能強大，在於它的大多數記錄可相互鏈臘寬接，既可在同一資料庫內鏈結，也可在資料庫之間進行鏈結。當運用blast軟體比較某氨基酸或dna序列與庫中其他氨基酸或dna序列差異即進行相似性檢索時，則會涉及到蛋白質庫或核苷酸庫的庫內鏈結。庫間鏈結發生在核苷酸資料庫內的記錄與pubmed庫中已發表序列的引文間的鏈結，或蛋白質序列記錄與核苷酸序列庫中編碼它的核苷酸序列間的鏈結。
blast(basic local alignment search tool）是用於序列相似性檢索的乙個重要資料庫，是區分基因和基因特徵的工具。該軟體能在15秒內完成整個dna資料庫的序列檢索。blast記錄的相關度有明確的統計學解釋，以便更容易地將相關記錄與隨機的資料庫記錄相區分。
在ncbi主頁的左工具條中，點選blast圖示，即進入blast主頁。
blast 主頁提供了幾種blast檢索軟體。其中是一種新的blast檢索工具，它在原有基礎上作了改進，執行速度更快，靈敏度更高，同時具有gapped blast 和psi-blast兩種軟體的新功能。gapped blast 允許在對準的序列中引入空位（鹼基缺失或插入），引入空位（gaps）意味著在比較兩個相關序列時不會出現中斷（break）現雹鄭象。
這些空位對準的記分系統更能反映相關序列的類似程度。psi-blast的全稱是position-specific iterated balst，即特殊位置重複blast，它提供了自動、易用的概貌（profile）檢索，是查詢序列同源的有效工具。
dnastar 可以用於解決你踢完的後半個問題。
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