設計一對合適引物,用以擴增乙醛脫氫酶

2023-03-03 16:40:20 字數 616 閱讀 6206

1樓:張家界瑞美

關鍵是要看你擴的片段有多長?一般擴的話用一對引物可以擴出1k多的片段。而用一個引物去測序的話一次只能測出600—700左右,而如果你擴的片段較長的話只用一條引物就沒法測通,可能就需要一對或者是更多的引物去測序了!

???兩對引物擴增???lz說的什麼意思?擴增後怎麼拼接呀??又沒有序列!

一般擴增用一對引物就行了,然後在根據你擴出來片段的大小絕定要用幾條引物進行測序!如果片段在1k左右需要2條引物測通!

同時這2條用於測序的引物可以是擴增的引物,但並不是所以pcr引物都能用於測序,以下這些pcr引物不適合用作測序的:簡併引物、隨機引物,如rapd引物、過長的引物(一般測序引物在18-24個鹼基)、有特殊標記的引物、不純的引物!

但是如果你的片段太長的話就需要更多的引物才能測通了!

2樓:匿名使用者

rating實際上是軟體本身通過二聚體、錯配、本身二級結構等情況和結合能為引物的好壞的一個「打分」。打分計算公式在「引數」選項中可以看到(就是ratingparameters)。原則上打分越高,引物的質量越好。

多條條帶是出現了非特異性擴增。一般是引物在模板上出現錯配造成的。引物二聚體大小一般出現在100~150bp的位置。

如何設計巢氏PCR的第一對引物,為什麼設計PCR引物時,後面那條引物設計出來後要反轉?

可以使用primer5 或者primerdesign設計 還是主要考慮髮夾結構,gc含量,tm值和引物交叉,還有減少引物二聚體的產生。如果是擴增啟動子的話,建議選擇引物的長度30 35bp,一般試劑盒裡有接頭引物的,只要在下游已知序列設計引物就可以咯 巢式pcr nested pcr 是指利用兩套p...

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