1樓：
看你設計簡便引物的要求了，一般來說是為了克隆家族基因。可以先把已知的序內列做blast分析，找到保容守的區域，根據保守區域設計引物。
用primer 5.0無非人工的選擇保守區內設計，沒有其他特別的功能。
引物長度不要太長，退火溫度低一點。
當然用密碼子的簡併性設計引物也可以，但是個人覺得分析、取捨有些麻煩。
簡併引物是什麼？設計的原則或原理是什麼
2樓：五月翔仔
利用ncbi搜尋不同物種中同一目的基因的蛋白質或cdna編碼的氨基酸序列 因為密碼子的關係，不同是指代表編碼單個氨基酸所有不同鹼基可能性的不同序列的混合物。密碼子具有簡併性，單以氨基酸順序推測編碼的dna序列是不精確的，但可以設計成對簡併引物，擴增所有編碼已知順序的核酸序列。用簡併引物時寡核苷酸中核苷酸序列可以改變，但核苷酸的數量應相同。
的核苷酸序列可能表達的氨基酸序列是相同的，所以氨基酸序列才是真正保守的
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