pcr到底要不要加鎂離子糾結

2021-03-06 19:14:40 字數 1003 閱讀 5866

1樓:半寂蓮燈

pcr反應需要加鎂離子,並且鎂離子濃度的總量應該比dntps的濃度高,常用1.5mmol/l。

鎂離子是加在pcr反應的緩衝液中的,成分是最複雜的,除水外一般包括四個有效成分:

1、緩衝體系,一般使用hepes或mops緩衝體系;

2、一價陽離子,一般採用鉀離子,但在特殊情況下也可使用銨根離子;

3、二價陽離子,即鎂離子,根據反應體系確定,除特殊情況外不需調整;

4、輔助成分,常見的有dmso、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助dna解除纏繞結構。

緩衝液的目的是提供合適的酸鹼度與某些離子,而pcr反應五要素是:引物(pcr引物為dn**段,細胞內dna複製的引物為一段rna鏈)、酶、dntp、模板和緩衝液(其中需要mg2+)。

標準的pcr過程:

1、dna變性

在90℃-96℃下,雙鏈dna模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈dna;

2、退火

在60℃-65℃下,系統溫度降低,引物與dna模板結合,形成區域性雙鏈;

3、延伸

在70℃-75℃下,在taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dntp為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的dna鏈。

每一迴圈經過變性、退火和延伸,dna含量即增加一倍。現在有些pcr因為擴增區很短,即使taq酶活性不是最佳也能在很短的時間內複製完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行,以減少一次升降溫過程,提高了反應速度。

2樓:北京索萊寶科技****

pcr的五大要素裡其中一個就是鎂離子,

一般來說,mg離子會對taq酶有啟用作用,會促進dna的合成,因為合成dna的時候,核苷酸進入聚合酶的活性中心也需要鎂離子來消除dna骨架上磷酸基團的負電荷,所以完全沒有mg離子是不太可能擴增好pcr的。一般來說,提高mg離子的濃度會增加pcr擴增的效率。但是,mg離子加多了之後,容易造成taq酶擴增的特異性降低,所以控制好mg離子的濃度對pcr來說還是很關鍵的。

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