1樓：帳號已登出
您好，go富集分析是一種常用啟頌差的生物資訊學分析方法，用於分析基因或蛋白質的功能富集情況。在撰寫go富集分析結果的文章時，可以按照以下步驟進行：
1. 結果概述：首先需悄皮要對分析結果進行概述，包括分析的資料集、使用的分析軟體、富集分析的結果等。
2. go註釋結果：介紹分析資料集的go註釋結果，包括註釋的基因或蛋白質數量、註釋的go術語數量等。
3. 富集分析結果：詳細介紹富集分析的結果，包括富集的go術語、富集的p值、富集的基因數量等。可以使用圖表來展示富集分析結果，如餅圖、柱狀圖等。
4. 功能分類分析：根據go術語的不同分類，對富集結果進行進一步的分析，如分析富集的生物學過程、分子功能和細胞組分等。
5. 生物學意義分析：根據富集分析結果，對分析資料集的生物學意義進行分析和討論，如**基因櫻笑或蛋白質在生物學過程中的作用、與其他基因或蛋白質的相互作用等。
在撰寫go富集分析結果的文章時，需要注意結果的準確性和可靠性，同時對結果進行詳細的解釋和分析，以便讀者理解和使用。
2樓：網友
1 首先需要明確go富集分析的結果，即哪些go term被富集了，哪些基因參與了富集，以及富集程度如何。
2 解釋結果需要包括富集分析的方法和引數設定，以及結果的生物學意義和可靠性。
同時還需要結合相關文獻和數雹哪據庫，對富集結果進行比較和驗證。
3 內容延伸可以包括對富集結果的功能註釋，基因網路分析，以及與其他實驗結源吵碼果的關聯分析等。
最終文章需要清晰地呈碰此現富集分析的結果和分析過程，以及對生物學問題的啟示和貢獻。
3樓：棒牽功舊
對於基因組學領域的研究，go富集分析是一種極其有用的工具，用於研究基因的功能和調控機制。go富集分析能夠幫助科學家從海量的基因資料中，發現某局差一特定生物慎咐學功能的基因組成，從而分析基因組的差異性。
go富集分析是一種基於統計學的分析方法，可以通過檢測基因組中某一特定生寬臘純物學功能的基因，來鑑定出其特徵和調控機制。研究人員可以根據go富集分析的結果，來探索基因組的結構和生物學功能的關係，以及基因組中可能存在的調控機制。同時，go富集分析也可以幫助科學家發現哪些基因可能對疾病的發生和發展起著重要作用。
go富集分析是乙個強有力的工具，可以幫助科學家從海量的基因資料中發現出具有特定生物學功能的基因組成，並有助於解析基因組的結構和生物學功能的關係以及可能存在的調控機制。因此，go富集分析在基因組學研究中的應用越來越廣泛，是基因組學研究的重要工具。
分析 | go 富集分析
4樓：清寧時光
從研一來到組裡，一直聽到 go 富集分析幾個字。直到現在，研二基本結束了，我都沒做過，也不會做。
有乙個大概的認識，就是，自己的基因集中某種功能基因的佔比要高於這種功能的基因在所有基因中的佔比。有很多人解釋得更清楚，比如go分析學習筆記、徐洲更的 基因表達分析（中）- 富集分析 、 轉錄組入門(8): 富集分析 。
我並不研究模式植物，而且已有的 orgdb 可能存在版本問題。所以 或 是待選方法。但是！
但是！在是否需要構建以及如何構建 orgdb 上，我又有了疑問。
在是否需要構建的問題上，我看到徐洲更在 功能註釋後如何做富集分析 中提到「你不需要構建orgdb，因為orgdb的用途是進行基因編號和go/kegg的轉換。你可以直接匯入基因號和go/kegg編號的對應關係到r裡面，然後用clusterprofiler進行資料分析」
在如何構建的問題上，網上也有許多文章進行了介紹。構建 orgdb 時，需要 gene_info 和 gene2go 。 gene_info 需要有兩列資訊 gid 和 gene_name 。
gene2go 需要三列資訊 gid 、 go 和 evidence 。
在眾多部落格中，都是用 eggnog 註釋所研究物種的蛋白質序列，再從註釋結果中提取資訊。我在重複的過程中，發現了其中的不一致，這個 gene_name 到底是什麼？ 詳細回顧非模式物種註釋構建過程 中選擇的是 seed_ortholog 列； 構建自己物種的orgdb 中選擇的是 eggnog annot 列； 使用annotationforge包輕鬆構建非模式物種orgdb包 中選擇的是不知道**冒出來的 列；還有選擇 prefered_name ..
有些列甚至不同版本的 eggnog 結果可能都不存在/不一致。
我的問題是，gene_name 選擇什麼重要嗎？這個東西是為 orgdb 的其他功能服務的？如果只是進行 go 富集分析，這個並不影響？
由於我的不求甚解，沒有對比結果，也沒有深究 orgdb 到底還能幹什麼。也許研四快結束的時候，就弄清楚了。還有，因為沒有其他證據，大家都把 evidence 定義為「iea」。
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用英語寫文章怎麼個寫法
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