如何查詢印記基因的差異甲基化區域

1樓：匿名使用者

找甲基化位點也就cpg島一般是有以下幾個方法：62616964757a686964616fe58685e5aeb931333363373739

1. msp,亞硫酸氫鹽轉化後,將你想測的基因區域（如啟動子區）轉入細菌質粒中,進行測序（金標準）.挑克隆7/10是甲基化的克隆認為這個位點70%甲基化.

大概可以測400+片段,但是問題是沒有辦法太精確,因為測得越多越精確,測太多太貴.

2. 焦磷酸測序,這裡指的是qiagen的pyromark焦磷酸測序,亞硫酸氫鹽轉化後,對於啟動子片段進行pcr擴增,測序,測出甲基化程度,儀器中q24有fda的認證,可以合作開發開發試劑盒.大概可以測60-70bp片段,勝在快速和穩定,但是引物設計成功率不高50%左右,適合小樣本.

3. massarray平臺進行甲基化檢測,用的是質譜法,也是亞硫酸氫鹽轉化,針對目標片段可以最多到500bp,但是問題是要求樣本量一般比較大,位點數*樣本數要等於384才好做,至少大於300因為那東西一張**384,用兩次就廢了,一週不用完也廢了.

4. 甲基化晶片如果你一還沒有找到基因那你用這個做個初篩不錯.

5. 甲基化測序,這個比較高階,也比較貴,25000一個,一般來說是去篩選未知的一些甲基化位點的方式,全基因組範疇,效果拔群.

如何查詢某個基因片段的甲基化位點

2樓：匿名使用者

找甲基化位點也就cpg島一般是有以下幾個方法：

1. msp,亞硫酸氫鹽轉化後,將你想測的基因區域（如啟動子區）轉入細菌質粒中,進行測序（金標準）.挑克隆7/10是甲基化的克隆認為這個位點70%甲基化.

大概可以測400+片段,但是問題是沒有辦法太精確,因為測得越多越精確,測太多太貴.

4. 甲基化晶片如果你一還沒有找到基因那你用這個做個初篩不錯.

5. 甲基化測序,這個比較高階,也比較貴,25000一個,一般來說是去篩選未知的一些甲基化位點的方式,全基因組範疇,效果拔群.

如何查詢某個基因片段的甲基化位點求解

3樓：鄉網處丶

這樣吧，給你發個文獻，自己看看（本人不是搞這一行的，無法說）！裡面介紹了 dna甲基化資料庫以及一個**甲基化位點的生物信心學工具！

如何尋找一個基因的甲基化調控位點？

4樓：匿名使用者

如何尋找一個基

bai因的甲基化調du控位點zhi

1. msp，亞硫酸氫鹽轉化後dao

，將你想測的基因區

回域（如啟動子區）轉入答細菌質粒中

2. 焦磷酸測序，這裡指的是qiagen的pyromark焦磷酸測序，亞硫酸氫鹽轉化後

3. massarray平臺進行甲基化檢測，用的是質譜法，也是亞硫酸氫鹽轉化

如何查詢一個基因是否有表觀遺傳學修飾

5樓：匿名使用者

日前，加州大學聖迭戈分校研究人員開發了一個程式，可以在dna序列的基礎上**表觀遺專傳學修飾的定位。他們用這屬個程式對人類胚胎細胞進行了分析。相關研究**刊登在了近期出版的《自然-方法》雜誌上。

**第一作者 john whitaker 表示：「雖然我們的細胞執行著不同的功能，但它們都有同樣的遺傳學藍圖。**細胞提供保護，神經細胞傳送訊號，它們之間存在差異是因為有不同的基因被活化或沉默。

」這些基因活化模式，受到表觀遺傳學修飾的控制。表觀遺傳學修飾可以在不改變dna序列的基礎上，決定特定細胞中的基因是否被讀取。

研究人員分析了有表觀遺傳學修飾和無表觀遺傳學修飾的序列，鑑定了與這些修飾有關的dna模式。他們在此基礎上開發了軟體epigram，epigram是一個通過dna模體**組蛋白修飾和dna甲基化模式的分析軟體。

第一印記調控區中的基因怎樣被調控表達